Evolução do IntergenicDB: banco de dados de regiões intergênicas de bactérias gram-negativas
Abstract
O banco de dados IntergenicDB contém informações sobre regiões intergênicas de bactérias gram negativas. Foi desenvolvido pelo grupo de pesquisa em Bioinformática da Universidade de Caxias do Sul, a ferramenta MMDBImportTool foi criada para popular os bancos de dados a partir dos dados extraídos dos bancos de dados públicos Genbank e Kegg. Nos últimos anos ocorreram mudanças no acesso e nos arquivos de bactérias disponibilizados pelo Genbank. Com isso, é preciso verificar se os dados armazenados no IntergenicDB estão coerentes com o GenBank. A partir disso, essa monografia tem como objetivo evoluir a ferramenta de importação MMDBImportTool. Foi verificada a necessidade de remodelagem de alguns processos da ferramenta de importação para que fosse possível a realização de uma nova carga de dados. Após o desenvolvimento e a documentação da MMDBImportTool, foi realizada uma nova carga no banco de dados. Essa nova carga conta com 118 organismos, 18 famílias e 9209 genes. [resumo fornecido pelo autor]