Desenvolvimento de uma ferramenta computacional para auxiliar na comparação de redes de proteínas
Abstract
A Biologia de Sistemas é uma área interdisciplinar crescente devido a importância em análise de grandes quantidades de dados. Um ramo muito importante dessa área é o estudo das interações entre as proteínas, com o objetivo de compreender melhor os processos que ocorrem entre esses sistemas buscando informações cruciais para o desenvolvimento de novos tratamentos e medicamentos. Essa interação proteica pode ser representada através de redes e o estudo sobre essas estruturas envolve diversas áreas como a teoria dos grafos, matemática discreta e processamento computacional. Um software bastante utilizado na área da Biologia é o Cytoscape que oferece várias operações para interação e análise de redes, mas essas operações possuem algumas restrições. O objetivo desse trabalho foi o desenvolvimento de uma ferramenta que possibilitasse aprimorar as operações de união, intersecção e diferença entre duas ou mais redes de proteínas, analisando-as ao mesmo tempo através de uma técnica de simplificação de redes em conjuntos de dados, com foco principal no desenvolvimento da operação de diferença simétrica. Essa ferramenta foi implementada em C# para ser utilizada via desktop que, através de uma interface gráfica, permite selecionar os arquivos de texto que contém as redes de proteínas e também selecionar as operações a serem aplicadas sobre essas redes, oferecendo respostas com mais informações aos usuários e gerando como resultado um arquivo de texto para cada operação realizada. [resumo fornecido pelo autor]