Análise de expressão diferencial de genes: uma solução computacional para identificação de biomarcadores de tumores gástricos em humanos
Data
2021-09-22Autor
Rossetto, Marcos Vinicius
Orientador
Silva, Scheila de Avila e
Metadata
Mostrar registro completoResumo
O Câncer é a segunda maior doença causadora de mortes mundialmente, sendo o câncer gástrico o terceiro mais fatal. Neste contexto, o presente trabalho tem por objetivo a identificação de possíveis biomarcadores em tumores de câncer gástrico humano, por meio do desenvolvimento de uma ferramenta computacional dedicada a exploração e visualização da expressão gênica diferencial e da análise de sobrevivência de pacientes clínicos. Na realização desta pesquisa, utilizou-se dados
de microarranjos disponibilizados no banco de dados público GEO com os seguintes códigos: GSE33335, GSE54129. Utilizando os conjuntos de dados, foram aplicados testes estatísticos na busca de genes estatisticamente diferencialmente expressos. Foram encontrados 39 genes com expressão diferencial entre o grupo de tecido tumoral e tecido não tumoral adjacente. Dentro desse grupo de genes diferencialmente expressos, foram selecionados os 3 genes com o menor p-value.
Estes genes foram submetidos a ferramenta C-Gemis (desenvolvimento próprio) para o enriquecimento dos dados utilizando os dados do repositório TCGA. Essa análise indicou que o gene SIDT2 apresentou potencial como biomarcador para câncer
gástrico do subtipo difuso da classificação de Laurén. [resumo fornecido pelo autor]