Aplicação web para análise de dados genéticos do workflow científico C-Gemis
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2023-11-30
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Workflows científicos tem se popularizado com o aumento de dados provenientes das áreas da genética. O grande volume de dados gerado por estas aplicações exige ferramentas capazes de realizarem a análise. Entre os workflows desenvolvidos é possível destacar o C-Gemis. C-Gemis é uma aplicação que tem como objetivo realizar a análise de genes na busca de biomarcadores do câncer gástrico. O projeto C-Gemis envolve diversas camadas de aplicação, abrangendo o processamento analítico de dados até a interação web com o usuário. Permite ao usuário informar genes, disponibilizando os resultados da análise. Entretanto em seu antigo estado não era possível obter os resultados, a possibilidade de download por parte do usuário era uma necessidade fundamental a ser implementada. Este trabalho teve por objetivo apresentar uma proposta de solução para uma nova interface gráfica web utilizando React e Typescript. Foi proposto a refatoração da camada web e da arquitetura geral do C-Gemis. Uma arquitetura com serviços isolados com a utilização de uma Application Programming Interface (API) desenvolvida em NodeJS. A escalabilidade da aplicação e a necessidade de futuras implementações foram levadas em consideração na proposta de solução. Foi possível desenvolver uma aplicação funcional, atendendo as necessidades requisitadas. O download dos resultados foi disponibilizado com sucesso. Foi implementado o Google Analytics, permitindo realizar análise da quantidade de acesso e entender o comportamento do usuário. Utilizando a Amazon Web Services (AWS) o C-Gemis foi disponibilizado para o uso do público alvo na internet. [resumo fornecido pelo autor]