Desenvolvimento de software para auxiliar no desenho de oligonucleotídeos
| dc.contributor.advisor | Martinotto, André Luis | |
| dc.contributor.author | Boschetti, Guilherme | |
| dc.contributor.other | Silva, Scheila de Avila e | |
| dc.contributor.other | Martinez, Gustavo Sganzerla | |
| dc.date.accessioned | 2022-03-16T18:29:23Z | |
| dc.date.available | 2022-03-16T18:29:23Z | |
| dc.date.issued | 2021-07-06 | |
| dc.date.submitted | 2021-06-25 | |
| dc.description | O presente trabalho apresentou como principal objetivo auxiliar no desenho de oligonucleotídeos (Primers e Sonda), que são utilizados nas técnicas de PCR e de PCR em tempo real, para a detecção de patógenos, especialmente em alimentos, a fim de controlar a qualidade dos alimentos para proteger a saúde dos consumidores. A implementação desenvolvida neste trabalho efetua a leitura de múltiplas sequências de DNA no formato FASTA, sendo uma delas a sequência alvo e as outras sequências similares não-alvo. Posteriormente, é realizado o alinhamento das sequências e as mesmas são comparadas buscando identificar as partes da sequência alvo que apresentam mais diferenças em relação às demais sequências. Essas partes da sequência alvo são utilizadas para o desenho dos oligonucleotídeos. Para o alinhamento das sequências foi utilizada biblioteca BioJava e para a identificação das diferenças foi utilizada a biblioteca Diff Match and Patch, que implementa o algoritmo de Myers. O software desenvolvido apresentou resultados promissores, conseguindo gerar bons desenhos de oligonucleotídeos para sequências pequenas, porém apresenta um consumo excessivo de memória no alinhamento das sequências, inviabilizando a utilização de sequências maiores. [resumo fornecido pelo autor] | pt_BR |
| dc.identifier.uri | https://repositorio.ucs.br/11338/9681 | |
| dc.language.iso | pt | pt_BR |
| dc.subject | Computação | pt_BR |
| dc.subject | Software - Desenvolvimento | pt_BR |
| dc.title | Desenvolvimento de software para auxiliar no desenho de oligonucleotídeos | pt_BR |
| dc.type | Monografia | pt_BR |
| local.aprovaaluno.publicacao | p | |
| local.aprovadocente.publicacao | n | |
| local.aptidao | patente, continuidade | |
| local.data.embargo | 2021-07-05 | |
| local.nota | 9,70 | |
| local.observacao | ||
| mtd2-br.advisor.instituation | Universidade de Caxias do Sul | pt_BR |
| mtd2-br.campus | Campus Universitário de Caxias do Sul | pt_BR |
| mtd2-br.program.name | Bacharelado em Ciência da Computação | pt_BR |
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