Paralelização de métodos de bioinformática utilizando grids computacionais
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Data de Submissão
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2009
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Gerhardt, Günther Johannes Lewczuk
Silva, Scheila de Ávila e
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Os recentes avanços da computação beneficiaram diversas áreas de pesquisa. Entre essas uma área com grande destaque é a biologia, que é o campo de estudo desse trabalho. Os avanços tecnológicos permitiram um aumento na capacidade dos processadores e, consequentemente, permitiram que uma quantidade maior de dados fosse analisada, e métodos mais complexos fossem utilizados. O uso de métodos nas pesquisas em bioinformática vem crescendo. Porém, quando na análise de sequências de DNA de organismos mais complexos, que possuem milhares de pares de bases, necessita-se de uma maior capacidade de processamento do que a disponibilizada por um único computador. Devido ao aumento da quantidade de dados a serem processados e com a necessidade de resultados mais imediatos, o uso de arquiteturas computacionais de alto desempenho, bem como, de programas específicos para essas arquiteturas são necessários. Dentro desse contexto nesse trabalho é feito um estudo do uso de computação de alto desempenho no processamento de sequências de DNA. Mais especificamente na paralelização de métodos utilizados pelo grupo de pesquisas em bioinformática da UCS. Para o desenvolvimento desse trabalho optou-se pela utilização de grids computacionais, uma vez que esse tipo de plataforma disponibiliza uma alta capacidade de processamento a um baixo custo (sic).