Análise de regiões intergênicas de escherichia coli utilizando ferramentas computacionais
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Data
2019-12-04Autor
Klauck, Hugo André
Orientador
Delamare, Ana Paula Longaray
Metadata
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Os genes são segmentos da molécula de ácido desoxirribonucleico (DNA) que contém as informações relacionadas às funções metabólicas necessárias para a sobrevivência de um organismo. O entendimento dos mecanismos que regulam a expressão gênica e a identificação destes elementos, contribui para a compreensão da funcionalidade dos genes em diferentes
espécies. O processo de transcrição de genes em bactérias se inicia através das interações entre a enzima RNA polimerase e regiões específicas no DNA chamadas promotoras, que interagindo com diferentes fatores σ, agem como reguladores chave da expressão gênica. A
bioinformática através de ferramentas computacionais tem contribuído gerando inferências que auxiliam na compreensão de diversos fenômenos biológicos, entre eles a predição de elementos regulatórios, da mesma forma, o crescimento de pesquisas computacionais tem
gerado grandes quantidades de dados, exigindo que as ferramentas computacionais estejam adaptadas para processamento e obtenção de resultados. O presente trabalho, utilizando regiões intergênicas extraídas do IntergenicDB, (i) verificou o desempenho de ferramentas
computacionais de predição de promotores disponíveis na internet; (ii) com o uso das ferramentas computacionais, apresenta uma análise comparativa de regiões intergênicas de linhagens de E. coli (comensal e patogênicas), procurando relacionar a estrutura dos
promotores com a capacidade patogênica e (iii) o desenvolvimento da integração de ferramentas de análise de sequências ao IntergenicDB através da criação de um web service.